On vuosi 1868, ja Edinburghissa asuva 9-vuotias Arthur Conan Doyle on päättänyt jäädä pois koulusta auttaakseen perhettään hankkimaan elannon. Syksyn suunnitelmat kuitenkin muuttuvat, kun Arthur kutsutaan poikkeuksellisten päättelykykyjensä myötä salaperäiseen Baskervillen kouluun Englantiin.

Sisäoppilaitoksessa opiskelee eri tavoin lahjakkaita lapsia, ja opiskelu on ilmaista. Arthur haetaan kouluun ilmalaivalla, ja perillä hän ystävystyy Irenen ja Jimmien kanssa – sekä saa vihollisekseen ylimielisen Sebastianin.

Kouluun saavuttuaan Arthur huomaa jotain kummallista ja pian selviää, että sinne on yritetty murtautua. Mutta mitä koulusta halutaan varastaa? Arthur saa myös kutsun Apila-salaseuran jäseneksi, tosin ensin on selvittävä kolmesta hankalasta testistä…